Oddział Otolaryngologii był pierwszym powstałym oddziałem w historii województwa olsztyńskiego w powojennej Polsce, a także pierwszy w historii całego regionu Warmii i Mazur, również rej przedwojennej. Otwarto go w styczniu 1950 r. w ówczesnym budynku Szpitala Wojewódzkiego, gdzie obecnie mieści się Szpital Miejski. Był to samodzielny 15-łóżkowy oddział. Twórcą i pierwszym ordynatorem był Bolesław Laszka. Absolwent Akademii Medycznej w Poznaniu, wówczas doktor nauk medycznych, specjalista otolaryngolog, a także medyk sądowy. Nietuzinkowa osobowość dr Laszki przyciągała wielu młodych lekarzy i wkrótce oddział stał się bazą, na której wykształciła się większość laryngologów Warmii i Mazur. Dziewięciu z nich objęło potem samodzielne stanowiska ordynatorów.

W oddziale nie tylko leczono pacjentów, ale także prowadzono działalność naukową. W 1965 r. dr Laszka, decyzją Rady Wydziału Akademii Medycznej w Gdańsku, na podstawie dorobku naukowego opartego na pracy w Olsztynie, uzyskał stopień doktora habilitowanego nauk medycznych.

Dalsza część historii oddziału rozpoczęła się w maju 1970 r. w budynku przy ul. Żołnierskiej. Po przeprowadzce oddział dysponował 30 łóżkami, rozlokowanymi w 3-osobowych salach i dwóch separatkach. Oddział wyposażono w nowoczesny sprzęt, dysponował też własną salą operacyjną w obrębie oddziału. Prowadzono na bazie oddziału szkolenie podyplomowe lekarzy specjalizujących się w laryngologii.

W roku 1979 przedwcześnie umiera doc. Laszka, a kierowanie oddziałem przejmuje jego uczeń dr Władysław Sawa. Pod koniec lat dziewięćdziesiątych ub. wieku oddział rozszerza swoją działalność o leczenie schorzeń onkologicznych, głównie raka krtani. Było to niezwykle potrzebne, ponieważ do tego czasu pacjenci z całego województwa zmuszeni byli do leczenia w odległych ośrodkach.

W kwietniu 2000 r. w drodze konkursu ordynatorem zostaje dr n. med. Bogdan Kibiłda, Działalność oddziału koncentruje się na kilku ważnych zagadnieniach klinicznych: leczeniu schorzeń uszu i górnych dróg oddechowych, onkologii laryngologicznej i leczeniu zakażeń i ich powikłań z zakresu głowy i szyi. W terapii wprowadza się nowe techniki mikrochirurgiczne i diagnostyczne. Zastosowanie lasera operacyjnego CO2 tworzy nową jakość w leczeniu schorzeń onkologicznych. Zapoczątkowana zostaje diagnostyka bezdechu sennego. Uruchamia się pracownię otoneurologii celem diagnozowania i leczenia zawrotów głowy. W leczeniu niedosłuchu wprowadza się wszczepianie implantów do kości skroniowej, natomiast po operacjach usunięcia krtani z powodu raka wszczepia się protezy głosowe. Rozwinięto chirurgię endoskopową nosa i zatok. W chirurgii rekonstrukcyjnej po operacjach onkologicznych stosuje się techniki mikrowaskularne z zastosowanie płatów wyspowych.

Po modernizacji w 2010 r. oddział dysponuje 20 łóżkami w 7 salach.

Od 2014 r. zabiegi odbywają się w nowoczesnym bloku operacyjnym, co bardzo podnosi bezpieczeństwo chorych.

Dzięki wspólnej pracy lekarzy i pielęgniarek, stale podnoszących swoje kwalifikacje zawodowe, oddział jest wysoko oceniany w ogólnopolskich rankingach oddziałów laryngologicznych:

• w 2004 r. (Newsweek) - 10 miejsce,
• w 2005 (Wprost) - 5 miejsce,
• w 2018 (Wprost) - 9 miejsce.