Profil hospitalizacji leczonych przypadków w oddziale obejmuje praktycznie cały wachlarz jednostek chorób przewodu pokarmowego, wątroby, trzustki, w tym wymagające szczególnie specjalistycznego nadzoru:

• ciężkie rzuty idiopatycznych chorób jelit (oddział jest jednostką odwoławczą w tych przypadkach dla całego regionu),
• ostrego zapalenia trzustki,
• zdekompensowanej marskości wątroby,
• nowotwory przewodu pokarmowego.

Oddział znajduje się na liście ośrodków referencyjnych leczenia nieswoistych zapalnych chorób jelit. Uczestniczy w Ogólnopolskim Rejestrze Osób z chorobą Leśniowskiego-Crohna.

Zabiegi i operacje wykonywane są w oddziale:

• endoskopie diagnostyczne górnego i dolnego odcinka przewodu pokarmowego
• endoskopie zabiegowe górnego i dolnego odcinka przewodu pokarmowego
• „trudne” polipektomie,
• mukozektomia endoskopowa (EMR)
• pH-metria oraz pH-metria z impedancją
• endosonografia przewodu pokarmowego (EUS), biopsja pod kontrolą EUS
• zabiegi z wykorzystaniem argonowej koagulacji plazmowej (APC)
• paracenteza terapeutyczna i diagnostyczna,
• zabiegi paliatywnego udrażniania przewodu pokarmowego w zaawansowanych chorobach nowotworowych,
• zakładanie gastrostomii odżywczych metodą endoskopową (PEG)
• endoskopowe leczenie achalazji,
• cholangiopankreatografia endoskopowa wsteczna (ECPW)