Blok operacyjny uruchomiono wraz otwarciem oddziału chirurgii. Pierwszą operację - wycięcie wyrostka robaczkowego - wykonano 1 grudnia 1970 r. Był to blok z sześcioma salami operacyjnymi na IV i V piętrze, w skrzydle nad głównym wejściem do szpitala.

Do sterylizacji narzędzi i drenów na początku służyły duże sterylizatory w wodą. Narzędzia układano na tacach perforowanych i gotowano, następnie wyjmowano z wrzątku na sterylne prześcieradła i zawijano. Krokiem naprzód było wprowadzenie sterylizacji narzędzi w autoklawach.

W szpitalu w innych oddziałach zabiegowych funkcjonowały małe sale operacyjne.

Rozwój medycyny przyspieszał, wykonywano coraz więcej nowych zabiegów i należało dostosować do nich blok. Wybudowano nowe skrzydło szpitala, w którym znalazł się blok operacyjny, jedna z największych i najnowocześniejszych jednostek tego typu na Warmii i Mazurach z 12-toma salami operacyjnymi, wyposażony w nowoczesny sprzęt oraz centralna sterylizatornia, w które zastosowano nowoczesne metody i techniki sterylizacji parowej, plazmowej, jak również tlenkiem etylenu. Obiekt zaczął funkcjonować na początku 2014 r. Była to największa inwestycja szpitala wojewódzkiego w ostatnim 20-leciu.