Na początku działalności Szpitala Wojewódzkiego Oddział Neurochirurgiczny stanowiły pojedyncze łóżka w Oddziale Chirurgicznym i Ortopedycznym. Pacjentami od 1970 r. zajmował się dr n. med. Stanisław Abramowicz.

Oddział z 27 łóżkami powstał w sierpniu 1976 r., jego ordynatorem został dr n. med. Henryk Tomczyk, a zastępcą dr n. med. Radosław Ponikarczyk. W 1980 r. konkurs na stanowisko ordynatora wygrał dr n. med. Jan Kopeć. Przez wszystkie te lata oddział doposażano w specjalistyczny sprzęt, który umożliwiał rozszerzenie zakresu świadczonych usług.

Współpraca z Zakładem Radiologii zacieśniła się po wyposażeniu go w tomograf komputerowy w 1992 r. Znacznie wzrosła liczba wykonywanych operacji i ich zakres - w 1994 r. przeprowadzono ich 500. Na postęp w diagnostyce i leczeniu wpłynęło zakupienie w 1996 r. rezonansu magnetycznego. Oddział miał jednak ograniczone możliwości przyjmowania chorych ze względu na małą liczbę łóżek.

W 2002 r. ordynorem został dr n. med. Waldemar Och. Na początku 2004 r. oddział przeszedł kapitalny remont. Do 30 zwiększyła się liczba łóżek 2-, 3-łóżkowe sale wyposażono w klimatyzację. Utworzono również sale intensywnego nadzoru neurochirurgicznego. W latach 2003-2006 oddział wykonywał 1000 zabiegów rocznie. Były to w większości procedury wysokospecjalistyczne: guzy podstawy czaszki, nowotwory mózgu, umiejscowione w strukturach ważnych życiowo, tzw. elokwentnych, czyli okolicy czuciowej, ruchowej, ośrodka mowy, czy okolicy struktur środkowych mózgu i pnia mózgowego. Zabiegi onkologiczne stanowiły 1/5 wykonywanych procedur, czyli około 200 rocznie. Inne wysokospecjalistyczne operacje dotyczyły m.in. zaopatrywania pękniętych tętniaków i malformacji naczyń mózgowych, zarówno metodą otwartą i wewnątrznaczyniową, guzów kanału kręgowego i śródrdzeniowych oraz operacje kręgosłupa związane ze schorzeniami zwyrodnieniowymi, dyskowymi oraz z urazami czaszkowo-mózgowymi. 

Kraniotomia z wybudzeniem śródoperacyjnym, to operacja, która została wykonana przez zespół interdyscyplinarny, złożony z neurochirurgów, anestezjologów, psychologa i personelu operacyjnego. Polega ona na usunięciu guza mózgu z zaoszczędzeniem funkcji neurologicznych szczególnie ważnych dla chorego, np. orientacji przestrzennej dla architekta. Wyróżnienie za w kategorii „Przedsiębiorstwo Odpowiedzialne Społecznie” konkursu samorządu województwa „Żagle Warmii i Mazur 2016” odebrał w imieniu zespołu operacyjnego dr Waldemar Och, ordynator Oddziału Klinicznego Neurochirurgicznego.